Home » Plastid-encoded Protein Clusters

Match clusters against a protein profile

Please specify the protein profile and press the button.

Protein profile Matching clusters
Species *
'Chlorella' mirabilis
Abies koreana
Acacia ligulata
Acidosasa purpurea
Acorus americanus
Acorus calamus
Acorus gramineus
Actinidia chinensis
Actinidia deliciosa
Acutodesmus obliquus
Adenophora remotiflora
Adiantum capillus-veneris
Aegilops bicornis
Aegilops cylindrica
Aegilops geniculata
Aegilops kotschyi
Aegilops longissima
Aegilops searsii
Aegilops sharonensis
Aegilops speltoides
Aegilops tauschii
Aethionema cordifolium
Aethionema grandiflorum
Agathis dammara
Ageratina adenophora
Agrostemma githago
Agrostis stolonifera
Ajuga reptans
Allium cepa
Allosyncarpia ternata
Alsophila spinulosa
Amborella trichopoda
Amentotaxus formosana
Ampelocalamus calcareus
Ananas comosus
Andrographis paniculata
Aneura mirabilis
Angiopteris angustifolia
Angiopteris evecta
Angophora costata
Angophora floribunda
Anomochloa marantoidea
Anthoceros angustus
Anthriscus cerefolium
Apios americana
Arabidopsis thaliana
Arabis alpina
Arabis hirsuta
Arachis hypogaea
Aralia undulata
Araucaria heterophylla
Ardisia polysticta
Aristida purpurea
Artemisia frigida
Artemisia montana
Arundinaria appalachiana
Arundinaria fargesii
Arundinaria gigantea
Arundinaria tecta
Asclepias nivea
Asclepias syriaca
Asterionella formosa
Asterionellopsis glacialis
Atropa belladonna
Aureococcus anophagefferens
Aureoumbra lagunensis
Auxenochlorella protothecoides
Azadirachta indica
Babesia bovis T2Bo
Bambusa arnhemica
Bambusa bambos
Bambusa emeiensis
Bambusa multiplex
Bambusa oldhamii
Barbarea verna
Bathycoccus prasinos
Berberis bealei
Bigelowiella natans
Bismarckia nobilis
Boea hygrometrica
Bomarea edulis
Botryococcus braunii
Boulardia latisquama
Bowenia serrulata
Brachypodium distachyon
Brassaiopsis hainla
Brassica napus
Bryopsis hypnoides
Bryopsis plumosa
Buergersiochloa bambusoides
Buxus microphylla
Calamus caryotoides
Calanthe triplicata
Calliarthron tuberculosum
Callitropsis nootkatensis
Callitropsis vietnamensis
Calocedrus formosana
Calycanthus floridus var. glaucus
Camellia crapnelliana
Camellia cuspidata
Camellia danzaiensis
Camellia grandibracteata
Camellia impressinervis
Camellia leptophylla
Camellia oleifera
Camellia petelotii
Camellia pitardii
Camellia pubicosta
Camellia reticulata
Camellia sinensis
Camellia taliensis
Camellia yunnanensis
Campanula takesimana
Campynema lineare
Cannabis sativa
Capsella bursa-pastoris
Capsicum annuum
Capsicum lycianthoides
Cardamine impatiens
Cardamine resedifolia
Carica papaya
Carludovica palmata
Castanea mollissima
Castanopsis echinocarpa
Catharanthus roseus
Cathaya argyrophylla
Cattleya crispata
Cedrus deodara
Cenchrus americanus
Centaurea diffusa
Centotheca lappacea
Cephalotaxus oliveri
Cephalotaxus wilsoniana
Cerataulina daemon
Ceratonia siliqua
Ceratophyllum demersum
Ceratozamia hildae
Chaetoceros simplex
Chaetosphaeridium globosum
Chara vulgaris
Chikusichloa aquatica
Chimonocalamus longiusculus
Chionochloa macra
Chlamydomonas reinhardtii
Chloranthus japonicus
Chloranthus spicatus
Chlorella sorokiniana
Chlorella variabilis
Chlorella vulgaris
Chlorokybus atmophyticus
Chondrus crispus
Choreocolax polysiphoniae
Choricystis parasitica
Chromera velia
Chromerida sp. RM11
Chrysanthemum indicum
Chrysanthemum x morifolium
Chrysobalanus icaco
Chusquea liebmannii
Chusquea spectabilis
Cicer arietinum
Cistanche deserticola
Cistanche phelypaea
Citrus aurantiifolia
Citrus sinensis
Coccomyxa subellipsoidea C-169
Cocos nucifera
Coffea arabica
Coix lacryma-jobi
Coleataenia prionitis
Colocasia esculenta
Conopholis americana
Corallorhiza bulbosa
Corallorhiza macrantha
Corallorhiza mertensiana
Corallorhiza odontorhiza
Corallorhiza trifida
Corallorhiza wisteriana
Corymbia eximia
Corymbia gummifera
Corymbia maculata
Corymbia tessellaris
Corynocarpus laevigata
Coscinodiscus radiatus
Couepia guianensis
Crucihimalaya wallichii
Cryptomeria japonica
Cryptomonas paramecium
Cucumis hystrix
Cucumis melo subsp. melo
Cucumis sativus
Cunninghamia lanceolata
Cupressus sempervirens
Curcuma roscoeana
Cuscuta exaltata
Cuscuta gronovii
Cuscuta obtusiflora
Cuscuta reflexa
Cyanidioschyzon merolae strain 10D
Cyanidium caldarium
Cyanophora paradoxa
Cycas debaoensis
Cycas revoluta
Cycas taitungensis
Cylindrotheca closterium
Cymbidium aloifolium
Cymbidium mannii
Cymbidium sinense
Cymbidium tortisepalum
Cymbidium tracyanum
Cynara humilis
Cypripedium formosanum
Cypripedium macranthos
Danthonia californica
Dasypogon bromeliifolius
Datura stramonium
Daucus carota
Dendrobium catenatum
Dendrocalamus latiflorus
Dendropanax dentiger
Deschampsia antarctica
Diandrolyra sp. Clark 1301
Dicloster acuatus
Dictyochloropsis reticulata
Didymosphenia geminata
Digitaria exilis
Dioscorea elephantipes
Dioscorea rotundata
Dioscorea zingiberensis
Diplopterygium glaucum
Draba nemorosa
Drimys granadensis
Dunalia brachyacantha
Dunalia obovata
Dunalia solanacea
Dunaliella salina
Durinskia baltica
Echinochloa oryzicola
Echites umbellatus
Ectocarpus siliculosus
Eimeria tenella strain Penn State
Elaeis guineensis
Eleutherococcus senticosus
Elliptochloris bilobata
Elodea canadensis
Elytrophorus spicatus
Emiliania huxleyi
Ephedra equisetina
Epifagus virginiana
Epipogium aphyllum
Epipogium roseum
Equisetum arvense
Equisetum hyemale
Eriachne stipacea
Erodium absinthoides
Erodium carvifolium
Erodium chrysanthum
Erodium crassifolium
Erodium gruinum
Erodium texanum
Erodium trifolium
Erycina pusilla
Ettlia pseudoalveolaris
Eucalyptus aromaphloia
Eucalyptus baxteri
Eucalyptus camaldulensis
Eucalyptus cladocalyx
Eucalyptus cloeziana
Eucalyptus curtisii
Eucalyptus deglupta
Eucalyptus delegatensis
Eucalyptus diversicolor
Eucalyptus diversifolia
Eucalyptus elata
Eucalyptus erythrocorys
Eucalyptus globulus subsp. globulus
Eucalyptus grandis
Eucalyptus guilfoylei
Eucalyptus marginata
Eucalyptus melliodora
Eucalyptus microcorys
Eucalyptus nitens
Eucalyptus obliqua
Eucalyptus patens
Eucalyptus polybractea
Eucalyptus radiata
Eucalyptus regnans
Eucalyptus saligna
Eucalyptus salmonophloia
Eucalyptus sieberi
Eucalyptus spathulata
Eucalyptus torquata
Eucalyptus umbra
Eucalyptus verrucata
Euglena gracilis
Euglena longa
Euglena viridis
Euglenaformis proxima
Eunotia naegelii
Eustrephus latifolius
Eutreptiella gymnastica
Fagopyrum esculentum subsp. ancestrale
Fagopyrum tataricum
Fargesia nitida
Fargesia spathacea
Fargesia yunnanensis
Ferrocalamus rimosivaginus
Festuca altissima
Festuca arundinacea
Festuca ovina
Festuca pratensis
Fistulifera solaris
Floydiella terrestris
Fragaria chiloensis
Fragaria iinumae
Fragaria mandshurica
Fragaria vesca subsp. bracteata
Fragaria vesca subsp. vesca
Fragaria virginiana
Francoa sonchifolia
Fritillaria cirrhosa
Fritillaria hupehensis
Fritillaria taipaiensis
Fucus vesiculosus
Fusochloris perforata
Galdieria sulphuraria
Gaoligongshania megalothyrsa
Gelidocalamus tessellatus
Geminella minor
Genlisea margaretae
Geranium palmatum
Ginkgo biloba
Gloeotilopsis sterilis
Glycine canescens
Glycine cyrtoloba
Glycine dolichocarpa
Glycine falcata
Glycine max
Glycine soja
Glycine stenophita
Glycine syndetika
Glycine tomentella
Glycyrrhiza glabra
Gnetum gnemon
Gnetum montanum
Gnetum parvifolium
Gonium pectorale
Goodyera fumata
Gossypium anomalum
Gossypium arboreum
Gossypium areysianum
Gossypium barbadense
Gossypium bickii
Gossypium capitis-viridis
Gossypium darwinii
Gossypium gossypioides
Gossypium herbaceum
Gossypium herbaceum subsp. africanum
Gossypium hirsutum
Gossypium incanum
Gossypium longicalyx
Gossypium mustelinum
Gossypium raimondii
Gossypium robinsonii
Gossypium somalense
Gossypium stocksii
Gossypium sturtianum
Gossypium thurberi
Gossypium tomentosum
Gossypium turneri
Gracilaria salicornia
Gracilaria tenuistipitata var. liui
Grateloupia taiwanensis
Greslania sp. McPherson 19217
Guadua weberbaueri
Guillardia theta
Guizotia abyssinica
Habenaria pantlingiana
Haematoxylum brasiletto
Hakonechloa macra
Hanabusaya asiatica
Helianthus annuus
Helianthus decapetalus
Helianthus divaricatus
Helianthus giganteus
Helianthus grosseserratus
Helianthus hirsutus
Helianthus maximiliani
Helianthus strumosus
Helianthus tuberosus
Heliconia collinsiana
Helicosporidium sp. ex Simulium jonesi
Heloniopsis tubiflora
Hesperelaea palmeri
Hesperocyparis glabra
Heterosigma akashiwo
Hevea brasiliensis
Hibiscus syriacus
Hickelia madagascariensis
Hirtella physophora
Hirtella racemosa
Hordeum vulgare subsp. vulgare
Huperzia lucidula
Hypseocharis bilobata
Illicium oligandrum
Indigofera tinctoria
Indocalamus longiauritus
Indocalamus wilsonii
Indosasa sinica
Interfilum terricola
Iochroma loxense
Iochroma nitidum
Iochroma stenanthum
Iochroma tingoanum
Ipomoea batatas
Ipomoea purpurea
Iris gatesii
Isachne distichophylla
Isoetes flaccida
Jacobaea vulgaris
Jasminum nudiflorum
Jatropha curcas
Juniperus bermudiana
Juniperus monosperma
Juniperus scopulorum
Juniperus virginiana
Kalopanax septemlobus
Keteleeria davidiana
Klebsormidium flaccidum
Koliella corcontica
Koliella longiseta
Kryptoperidinium foliaceum
Lactuca sativa
Larix decidua
Lasthenia burkei
Lathyrus clymenum
Lathyrus davidii
Lathyrus graminifolius
Lathyrus inconspicuus
Lathyrus japonicus
Lathyrus littoralis
Lathyrus ochroleucus
Lathyrus odoratus
Lathyrus palustris
Lathyrus pubescens
Lathyrus sativus
Lathyrus tingitanus
Lathyrus venosus
Lecomtella madagascariensis
Leersia tisserantii
Lemna minor
Lens culinaris
Lepidium virginicum
Lepidodinium chlorophorum
Leptocylindrus danicus
Leptosira terrestris
Leucocytozoon caulleryi
Libidibia coriaria
Licania alba
Licania heteromorpha
Licania sprucei
Lilium superbum
Lindenbergia philippensis
Liquidambar formosana
Liriodendron tulipifera
Lithachne pauciflora
Lithocarpus balansae
Lithodesmium undulatum
Lobosphaera incisa
Lobularia maritima
Lolium multiflorum
Lolium perenne
Lonicera japonica
Lotus japonicus
Lupinus albus
Lupinus luteus
Luzuriaga radicans
Lygodium japonicum
Lysimachia coreana
Macadamia integrifolia
Magnolia cathcartii
Magnolia dealbata
Magnolia denudata
Magnolia grandiflora
Magnolia kobus
Magnolia kwangsiensis
Magnolia liliifera
Magnolia odora
Magnolia officinalis
Magnolia officinalis subsp. biloba
Magnolia pyramidata
Magnolia salicifolia
Magnolia sinica
Magnolia sprengeri
Magnolia tripetala
Magnolia yunnanensis
Manihot esculenta
Mankyua chejuensis
Marchantia polymorpha
Marsilea crenata
Marvania geminata
Masdevallia coccinea
Masdevallia picturata
Medicago hybrida
Medicago papillosa
Medicago truncatula
Megaleranthis saniculifolia
Melianthus villosus
Mesostigma viride
Mesotaenium endlicherianum
Metapanax delavayi
Micromonas sp. RCC299
Microthamnion kuetzingianum
Millettia pinnata
Monachather paradoxus
Monomastix sp. OKE-1
Monomorphina aenigmatica
Monsonia speciosa
Morus indica
Morus mongolica
Morus notabilis
Musa textilis
Myriopteris lindheimeri
Myrmecia israelensis
Nageia nagi
Najas flexilis
Nandina domestica
Nannochloropsis gaditana
Nannochloropsis granulata
Nannochloropsis limnetica
Nannochloropsis oceanica
Nannochloropsis oculata
Nannochloropsis salina
Nasturtium officinale
Nelumbo lutea
Nelumbo nucifera
Neocystis brevis
Neohouzeaua sp. Clark & Attigala 1712
Neololeba atra
Neottia nidus-avis
Nephroselmis astigmatica
Nephroselmis olivacea
Nerium oleander
Neyraudia reynaudiana
Nicotiana sylvestris
Nicotiana tabacum
Nicotiana tomentosiformis
Nicotiana undulata
Nuphar advena
Nyholmiella obtusifolia
Nymphaea alba
Nymphaea mexicana
Odontella sinensis
Oedogonium cardiacum
Oenothera argillicola
Oenothera biennis
Oenothera elata subsp. hookeri
Oenothera glazioviana
Oenothera parviflora
Olea europaea
Olea europaea subsp. cuspidata
Olea europaea subsp. europaea
Olea europaea subsp. maroccana
Olea woodiana subsp. woodiana
Oligostachyum shiuyingianum
Olimarabidopsis pumila
Olmeca reflexa
Oltmannsiellopsis viridis
Olyra latifolia
Oncidium hybrid cultivar
Oncinotis tenuiloba
Ophioglossum californicum
Orobanche californica
Orobanche crenata
Orobanche gracilis
Orobanche purpurea
Orobanche ramosa
Orthotrichum rogeri
Oryza australiensis
Oryza glaberrima
Oryza meridionalis
Oryza nivara
Oryza rufipogon
Oryza sativa Indica Group
Oryza sativa Japonica Group
Osmundastrum cinnamomeum
Ostreococcus tauri
Otatea acuminata
Pabia signiensis
Pachycladon cheesemanii
Pachycladon enysii
Pachyrhizus erosus
Paeonia obovata
Panax ginseng
Panax notoginseng
Panicum virgatum
Paphiopedilum armeniacum
Paphiopedilum niveum
Parachlorella kessleri
Paradoxia multiseta
Pariana radiciflora
Parinari campestris
Paris verticillata
Parthenium argentatum
Paulinella chromatophora
Pavlova lutheri
Pedinomonas minor
Pedinomonas tuberculata
Pelargonium alternans
Pelargonium x hortorum
Pellia endiviifolia
Pentactina rupicola
Pentalinon luteum
Penthorum chinense
Petrosavia stellaris
Phaeocystis antarctica
Phaeocystis globosa
Phaeodactylum tricornutum
Phalaenopsis aphrodite subsp. formosana
Phalaenopsis equestris
Phalaenopsis hybrid cultivar
Pharus lappulaceus
Pharus latifolius
Phaseolus vulgaris
Phoenix dactylifera
Phragmites australis
Phyllostachys edulis
Phyllostachys nigra var. henonis
Phyllostachys propinqua
Phyllostachys sulphurea
Physalis peruviana
Physcomitrella patens
Picea abies
Picea morrisonicola
Picea sitchensis
Picocystis salinarum
Pinguicula ehlersiae
Pinus contorta
Pinus gerardiana
Pinus koraiensis
Pinus krempfii
Pinus lambertiana
Pinus massoniana
Pinus monophylla
Pinus nelsonii
Pinus strobus
Pinus taeda
Pinus thunbergii
Piper cenocladum
Pisum sativum
Planctonema lauterbornii
Plasmodium chabaudi chabaudi
Plasmodium chabaudi chabaudi
Platanus occidentalis
Pleioblastus maculatus
Pleodorina starrii
Podocarpus lambertii
Podocarpus totara
Populus alba
Populus balsamifera
Populus cathayana
Populus euphratica
Populus fremontii
Populus trichocarpa
Populus yunnanensis
Porphyra purpurea
Porphyridium purpureum
Prasinoderma coloniale
Praxelis clematidea
Premna microphylla
Primula poissonii
Prinsepia utilis
Prosopis glandulosa
Prunus kansuensis
Prunus maximowiczii
Prunus mume
Prunus padus
Prunus persica
Prunus yedoensis
Pseudendoclonium akinetum
Pseudochloris wilhelmii
Pseudophoenix vinifera
Pseudotsuga sinensis var. wilsoniana
Psilotum nudum
Pteridium aquilinum subsp. aquilinum
Ptilidium pulcherrimum
Puelia olyriformis
Pycnococcus provasolii
Pyramimonas parkeae
Pyropia haitanensis
Pyropia perforata
Pyropia yezoensis
Pyrus pyrifolia
Pyrus spinosa
Quercus aliena
Quercus aquifolioides
Quercus rubra
Quercus spinosa
Raddia brasiliensis
Ranunculus macranthus
Raphanus sativus
Ravenala madagascariensis
Retrophyllum piresii
Rhazya stricta
Rhizanthella gardneri
Rhizosolenia imbricata
Rhodomonas salina
Rhynchoryza subulata
Ricinus communis
Robinia pseudoacacia
Roundia cardiophora
Roya anglica
Sabal domingensis
Saccharina japonica
Saccharum hybrid cultivar NCo 310
Saccharum hybrid cultivar SP80-3280
Salix interior
Salix purpurea
Salix suchowensis
Salvia miltiorrhiza
Sanionia uncinata
Sapindus mukorossi
Saracha punctata
Sarocalamus faberi
Sartidia dewinteri
Sartidia perrieri
Schefflera delavayi
Schizomeris leibleinii
Schwalbea americana
Scrophularia takesimensis
Secale cereale
Sedum sarmentosum
Sedum takesimense
Selaginella moellendorffii
Sesamum indicum
Setaria italica
Silene chalcedonica
Silene conica
Silene conoidea
Silene latifolia
Silene noctiflora
Silene paradoxa
Silene vulgaris
Solanum bulbocastanum
Solanum cheesmaniae
Solanum chilense
Solanum galapagense
Solanum habrochaites
Solanum lycopersicum
Solanum neorickii
Solanum peruvianum
Solanum pimpinellifolium
Solanum tuberosum
Sorghum bicolor
Sorghum timorense
Spinacia oleracea
Spirodela polyrhiza
Stangeria eriopus
Staurastrum punctulatum
Stichococcus bacillaris
Stigeoclonium helveticum
Stockwellia quadrifida
Syntrichia ruralis
Taiwania cryptomerioides
Taiwania flousiana
Tamarindus indica
Taxus mairei
Tectona grandis
Tetracentron sinense
Tetraphis pellucida
Thalassiosira oceanica CCMP1005
Thalassiosira pseudonana
Thalassiosira weissflogii
Thalictrum coreanum
Thamnocalamus spathiflorus
Theileria parva strain Muguga
Theobroma cacao
Thysanolaena latifolia
Toxoplasma gondii RH
Trachelium caeruleum
Trachydiscus minutus
Trebouxiophyceae sp. MX-AZ01
Trifolium aureum
Trifolium boissieri
Trifolium glanduliferum
Trifolium grandiflorum
Trifolium meduseum
Trifolium repens
Trifolium strictum
Trifolium subterraneum
Trigonobalanus doichangensis
Trillium cuneatum
Trithuria inconspicua
Triticum aestivum
Triticum macha
Triticum monococcum
Triticum timopheevii
Triticum turgidum
Triticum urartu
Trochodendron aralioides
Tydemania expeditionis
Typha latifolia
Ulnaria acus
Utricularia gibba
Utricularia macrorhiza
Vaccinium macrocarpon
Vanilla planifolia
Vaucheria litorea
Veratrum patulum
Vertebrata lanosa
Vicia sativa
Vigna angularis
Vigna radiata
Vigna unguiculata
Viola seoulensis
Vitis rotundifolia
Vitis vinifera
Viviania marifolia
Watanabea reniformis
Welwitschia mirabilis
Wolffia australiana
Wolffiella lingulata
Xerophyllum tenax
Xylochloris irregularis
Yushania levigata
Zamia furfuracea
Zea mays
Zingiber spectabile
Zizania aquatica
Zygnema circumcarinatum
All the clusters match the given profile.
© 2014 Lab.No6, IITP RAS