Home » Plastid-encoded Protein Clusters

Match clusters against a protein profile

Please specify the protein profile and press the button.

Protein profile Matching clusters
Species *
Acidosasa purpurea
Acorus americanus
Acorus calamus
Aegilops cylindrica
Aegilops geniculata
Aegilops speltoides
Aegilops tauschii
Aethionema cordifolium
Aethionema grandiflorum
Ageratina adenophora
Agrostemma githago
Agrostis stolonifera
Ajuga reptans
Allosyncarpia ternata
Amborella trichopoda
Andrographis paniculata
Angophora costata
Angophora floribunda
Anomochloa marantoidea
Anthriscus cerefolium
Arabidopsis thaliana
Arabis alpina
Arabis hirsuta
Aralia undulata
Ardisia polysticta
Artemisia frigida
Arundinaria appalachiana
Arundinaria gigantea
Arundinaria tecta
Asclepias nivea
Asclepias syriaca
Atropa belladonna
Azadirachta indica
Bambusa emeiensis
Bambusa oldhamii
Barbarea verna
Berberis bealei
Bismarckia nobilis
Boea hygrometrica
Brachypodium distachyon
Brassaiopsis hainla
Brassica napus
Buxus microphylla
Calamus caryotoides
Calycanthus floridus var. glaucus
Camellia cuspidata
Camellia danzaiensis
Camellia impressinervis
Camellia oleifera
Camellia pitardii
Camellia sinensis
Camellia taliensis
Camellia yunnanensis
Capsella bursa-pastoris
Capsicum annuum
Carica papaya
Castanea mollissima
Castanopsis echinocarpa
Catharanthus roseus
Ceratophyllum demersum
Chloranthus spicatus
Chrysanthemum indicum
Chrysanthemum x morifolium
Chrysobalanus icaco
Cicer arietinum
Cistanche deserticola
Citrus sinensis
Cocos nucifera
Coffea arabica
Coix lacryma-jobi
Colocasia esculenta
Conopholis americana
Corymbia eximia
Corymbia gummifera
Corymbia maculata
Corymbia tessellaris
Corynocarpus laevigata
Crucihimalaya wallichii
Cucumis hystrix
Cucumis melo subsp. melo
Cucumis sativus
Curcuma roscoeana
Cuscuta exaltata
Cuscuta gronovii
Cuscuta obtusiflora
Cuscuta reflexa
Cymbidium aloifolium
Cymbidium mannii
Cymbidium sinense
Cymbidium tortisepalum
Cymbidium tracyanum
Dasypogon bromeliifolius
Datura stramonium
Daucus carota
Dendrobium officinale
Dendrocalamus latiflorus
Deschampsia antarctica
Dioscorea elephantipes
Draba nemorosa
Drimys granadensis
Elaeis guineensis
Eleutherococcus senticosus
Elodea canadensis
Epifagus virginiana
Erodium carvifolium
Erodium texanum
Erycina pusilla
Eucalyptus aromaphloia
Eucalyptus baxteri
Eucalyptus camaldulensis
Eucalyptus cladocalyx
Eucalyptus cloeziana
Eucalyptus curtisii
Eucalyptus deglupta
Eucalyptus delegatensis
Eucalyptus diversicolor
Eucalyptus diversifolia
Eucalyptus elata
Eucalyptus erythrocorys
Eucalyptus globulus subsp. globulus
Eucalyptus grandis
Eucalyptus guilfoylei
Eucalyptus marginata
Eucalyptus melliodora
Eucalyptus microcorys
Eucalyptus nitens
Eucalyptus obliqua
Eucalyptus patens
Eucalyptus polybractea
Eucalyptus radiata
Eucalyptus regnans
Eucalyptus saligna
Eucalyptus salmonophloia
Eucalyptus sieberi
Eucalyptus spathulata
Eucalyptus torquata
Eucalyptus umbra
Eucalyptus verrucata
Fagopyrum esculentum subsp. ancestrale
Ferrocalamus rimosivaginus
Festuca altissima
Festuca arundinacea
Festuca ovina
Festuca pratensis
Fragaria chiloensis
Fragaria mandshurica
Fragaria vesca subsp. bracteata
Fragaria vesca subsp. vesca
Fragaria virginiana
Francoa sonchifolia
Fritillaria taipaiensis
Geranium palmatum
Glycine canescens
Glycine cyrtoloba
Glycine dolichocarpa
Glycine falcata
Glycine max
Glycine soja
Glycine stenophita
Glycine syndetika
Glycine tomentella
Glycyrrhiza glabra
Gossypium anomalum
Gossypium arboreum
Gossypium areysianum
Gossypium barbadense
Gossypium bickii
Gossypium capitis-viridis
Gossypium darwinii
Gossypium gossypioides
Gossypium herbaceum
Gossypium herbaceum subsp. africanum
Gossypium hirsutum
Gossypium incanum
Gossypium longicalyx
Gossypium mustelinum
Gossypium raimondii
Gossypium robinsonii
Gossypium somalense
Gossypium stocksii
Gossypium sturtianum
Gossypium thurberi
Gossypium tomentosum
Guizotia abyssinica
Helianthus annuus
Helianthus decapetalus
Helianthus divaricatus
Helianthus giganteus
Helianthus grosseserratus
Helianthus hirsutus
Helianthus maximiliani
Helianthus strumosus
Helianthus tuberosus
Heliconia collinsiana
Hevea brasiliensis
Hirtella racemosa
Hordeum vulgare subsp. vulgare
Hypseocharis bilobata
Illicium oligandrum
Indocalamus longiauritus
Ipomoea purpurea
Jacobaea vulgaris
Jasminum nudiflorum
Jatropha curcas
Kalopanax septemlobus
Lactuca sativa
Lathyrus sativus
Leersia tisserantii
Lemna minor
Lepidium virginicum
Licania alba
Licania heteromorpha
Licania sprucei
Lindenbergia philippensis
Liquidambar formosana
Liriodendron tulipifera
Lobularia maritima
Lolium multiflorum
Lolium perenne
Lotus japonicus
Lupinus luteus
Magnolia cathcartii
Magnolia dealbata
Magnolia denudata
Magnolia grandiflora
Magnolia kobus
Magnolia kwangsiensis
Magnolia liliifera
Magnolia liliiflora
Magnolia odora
Magnolia officinalis
Magnolia officinalis subsp. biloba
Magnolia pyramidata
Magnolia salicifolia
Magnolia sinica
Magnolia sprengeri
Magnolia tripetala
Manihot esculenta
Medicago truncatula
Megaleranthis saniculifolia
Melianthus villosus
Metapanax delavayi
Millettia pinnata
Monsonia speciosa
Morus indica
Musa textilis
Najas flexilis
Nandina domestica
Nasturtium officinale
Nelumbo lutea
Nelumbo nucifera
Neottia nidus-avis
Nicotiana sylvestris
Nicotiana tabacum
Nicotiana tomentosiformis
Nicotiana undulata
Nuphar advena
Nymphaea alba
Oenothera argillicola
Oenothera biennis
Oenothera elata subsp. hookeri
Oenothera glazioviana
Oenothera parviflora
Olea europaea
Olea europaea subsp. cuspidata
Olea europaea subsp. europaea
Olea europaea subsp. maroccana
Olea woodiana subsp. woodiana
Olimarabidopsis pumila
Oncidium hybrid cultivar
Orobanche gracilis
Orobanche purpurea
Orobanche ramosa
Oryza meridionalis
Oryza nivara
Oryza rufipogon
Oryza rufipogon
Oryza sativa Indica Group
Oryza sativa Japonica Group
Pachycladon cheesemanii
Pachycladon enysii
Panax ginseng
Panicum virgatum
Parthenium argentatum
Pelargonium alternans
Pelargonium x hortorum
Pentactina rupicola
Penthorum chinense
Petrosavia stellaris
Phalaenopsis aphrodite subsp. formosana
Phalaenopsis equestris
Pharus lappulaceus
Pharus latifolius
Phaseolus vulgaris
Phoenix dactylifera
Phragmites australis
Phyllostachys edulis
Phyllostachys nigra var. henonis
Phyllostachys propinqua
Pinguicula ehlersiae
Piper cenocladum
Pisum sativum
Platanus occidentalis
Populus alba
Populus trichocarpa
Praxelis clematidea
Prinsepia utilis
Prunus kansuensis
Prunus mume
Prunus persica
Pseudophoenix vinifera
Puelia olyriformis
Pyrus pyrifolia
Pyrus spinosa
Quercus rubra
Ranunculus macranthus
Ravenala madagascariensis
Rhizanthella gardneri
Rhynchoryza subulata
Ricinus communis
Saccharum hybrid cultivar NCo 310
Saccharum hybrid cultivar SP80-3280
Salvia miltiorrhiza
Schefflera delavayi
Schwalbea americana
Secale cereale
Sedum sarmentosum
Sesamum indicum
Setaria italica
Silene chalcedonica
Silene conica
Silene conoidea
Silene latifolia
Silene noctiflora
Silene paradoxa
Silene vulgaris
Solanum bulbocastanum
Solanum lycopersicum
Solanum lycopersicum
Solanum tuberosum
Sorghum bicolor
Sorghum timorense
Spinacia oleracea
Spirodela polyrhiza
Stockwellia quadrifida
Tectona grandis
Tetracentron sinense
Theobroma cacao
Trachelium caeruleum
Trifolium aureum
Trifolium grandiflorum
Trifolium repens
Trifolium subterraneum
Trigonobalanus doichangensis
Trithuria inconspicua
Triticum aestivum
Triticum monococcum
Triticum urartu
Trochodendron aralioides
Typha latifolia
Utricularia gibba
Vaccinium macrocarpon
Veratrum patulum
Vigna angularis
Vigna radiata
Vigna unguiculata
Vitis rotundifolia
Vitis vinifera
Viviania marifolia
Wolffia australiana
Wolffiella lingulata
Zea mays
Zingiber spectabile
All the clusters match the given profile.
© 2012-2013 Lab.No6, IITP RAS