Избранные гранты

В лаборатории выполняются или выполнены гранты, среди которых отметим наиболее значимые:

• Грант РНФ № 24-44-00099 «Создание базы данных траекторий специализации клеток в эволюции и индивидуальном развитии» (2024-2026)
• Грант РФФИ № 18-29-13037 «Гены млекопитающих, потеря которых связана с геронтологическим успехом» (2018–2021)
• Соглашение 14-50-00150 РНФ и ИППИ (2014–2018)
• Грант РФФИ № 13-04-40196-Н «Широкомасштабный биоинформатический поиск генов, играющих важную роль в развитии мозга и регенерации придатков тела» (2013–2015)
• Грант МНТЦ № 2766 «Новые методы компьютерной аннотации бактериальных геномов: разработка и применение» (2004–2007)
• Грант МНТЦ № 3807 «Сравнительная геномика и метагеномика: модели, алгоритмы и массовый анализ; нанотехнологии для избирательного транспорта» (2008–2011)

Избранные гранты лаборатории включают следующие:

• Грант РНФ № 24-44-00099 (2024-2026) «Создание базы данных траекторий специализации клеток в эволюции и индивидуальном развитии»
• Грант ФСИ № 4436ГС1/72572 (2022-2023) «Разработка сервиса для экстраполяции экспрессионного клеточного ответа в экспериментальной биологии и медицине на основе технологий анализа Big Data»
• Грант РФФИ № 18-29-13037 (2018–2021) «Гены млекопитающих, потеря которых связана с геронтологическим успехом»
• Грант РФФИ № 18-04-00574 (2018-2020) «Эволюционная геномика и молекулярная филогенетика мхов и печеночников»
• Грант РФФИ № 17-01-00705 (2017–2019) «Проблемы эффективной классификации в теоретико-множественных структурах»
• Грант РНФ № 14-50-00029 (2015-2018) «Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем»
• Грант РНФ № 14-50-00150 (2014–2018) «Цифровые технологии и их применения»
• Грант РФФИ № 15-29-02765 (2015–2017) «Эукариотическое биоразнообразие сфагновых болот: метагеномный подход»
• Грант РФФИ № 15-04-05841 (2015-2017) «Необычные митохондриальные геномы животных и простейших»
• Грант РФФИ № 16-34-50265 (2016) «Пути эволюции споровиков (Apicomplexa): молекулярно-филогенетические исследования представителей базальных групп»
• Грант РНФ № 14-14-00262 (2014-2016) «Решение вопроса о положении Lophophorata в системе животного царства: морфологический, онтогенетический, палеонтологический и молекулярно-биологический аспекты»
• Грант РФФИ № 15-34-50492 (2015) «Молекулярно-генетическая характеристика низших грибных и грибообразных паразитов одноклеточных водорослей»
• Грант РФФИ № 13-04-40196-Н (2013–2015) «Широкомасштабный биоинформатический поиск генов, играющих важную роль в развитии мозга и регенерации придатков тела»
• Грант РФФИ № 13-04-01084 (2013–2015) «Роль Wnt сигнального пути в эмбриональных и постэмбриональных морфогенезах губки Halisarca dujardini (Porifera: Demospongiae)»
• Грант РФФИ № 13-01-00006 (2013–2015) «Проблемы эффективной классификации в дескриптивной теории множеств»
• Соглашение с Минобрнауки 8481 (2012–2013) «Регуляция экспрессии генов, её механизмы и эволюция. Разработка высокопроизводительных технологий обработки геномных данных для реконструкции сценариев совместной эволюции регуляторных систем и биологических видов»
• Грант РФФИ № 12-04-93002-Вьет_а (2012–2013) «Фауна и экология свободноживущих нематод мангровых сообществ Северного Вьетнама на примере дельты Красной Реки»
• Контракт с Минобрнауки 14.740.11.1053 (2011–2013) «Новые технологии реконструкции совместной эволюции регуляторных систем, пластид, генов и видов бактерий и простейших»
• Грант РФФИ № 11-04-00690-а (2011–2013) «Целомическая система форонид и проблема целомической метамерии Lophophorata»
• Контракт с Минобрнауки 14.740.11.0624 (2010–2012) «Регуляция генов и эволюция регуляции у бактерий, пластид и паразитических простейших»
• Соглашение с Минобрнауки 8091 (2012–2012) «Массовый поиск и анализ процессов транскрипционной регуляции экспрессии генов в пластидах и митохондриях»
• Соглашение с Минобрнауки 8858 (2012–2012) «Регуляция экспрессии генов у прокариот и простейших, включая возбудителей туберкулеза, токсоплазмоза и малярии»
• Контракт с Минобрнауки П1162 (2010–2012) «Эволюция молекулярно-генетического аппарата клетки»
• Контракт с Минобрнауки 14.740.12.0830 (2011–2011) «Процессы регуляции экспрессии генов в пластидах растений, водорослей, простейших и их эволюция»
• Международное академическое соглашение РАН – CNRS, №23989 (2010–2011) «Моделирование эволюции гена вдоль данного дерева видов на основе гомологии белков из базы данных Hogenom»
• Контракт с Минобрнауки НК-421П (2009–2011) «Механизмы регуляции экспрессии генов бактерий, пластид растений и простейших»
• Контракт с Минобрнауки П2152 (2009–2011) «Новые клеточные технологии борьбы с протозойными инфекциями человека и животных»
• Контракт с Минобрнауки П2370 (2009–2011) «Механизмы регуляции экспрессии генов бактерий, пластид растений и простейших»
• Грант РФФИ № 09-04-01523-а (2009–2011) «Разнообразие и специфичность веслоногих ракообразных (Copepoda) – симбионтов морских беспозвоночных»
• Грант Международного Научно-технического Центра (МНТЦ) Проект 3807 (2008–2011) «Сравнительная геномика и метагеномика: модели, алгоритмы и массовый анализ; нанотехнологии для избирательного транспорта» (“Comparative genomics and metagenomics: models, algorithms and large scale analysis; nanotechnologies for selective transport”)
• Грант РФФИ № 08-04-01746-а (2008–2010) «Молекулярные синапоморфии в филогеномике многоклеточных животных как критерий надежности реконструкции филогенетических отношений»
• Грант РФФИ № 08-04-00991-а (2008–2010) «Нервная система форонид: ультраструктура, иммуноцитохимия, развитие»
• Международный проект Hausdorff Edition, Nordrhein-Westfaеlischen Akademie der Wissenschaften, Germany, Forschungsprojekt, 98060006 (1999–2010)
• Международный проект совместных работ РАН – CNRS (Франция), UMR 7089, №47659, (2008–2009) «Регуляция экспрессии генов, эволюция регуляторных сигналов у бактерий: анализ вторичной структуры методами автоматической верификации»
• Грант РФФИ № 07-01-00445-а (2007–2009) «Классификация финальных структур Хаусдорфа».
• Соглашение о международном научном сотрудничестве с Центром эволюционной функциональной геномики Института Биодизайна Университета Аризоны, США [Center for Evolutionary Functional Genomics, the Biodesign Institute, Arizona State University, USA] (2006–2009)
• Договор № СГ-4/1/07 (2007–2008) на выполнение работ по теме «Построение эволюционного дерева жизни: филогеномика многоклеточных организмов» в рамках научно-технической программы Союзного государства «Разработка и использование программно-аппаратных средств Грид-технологий перспективных высокопроизводительных (суперкомпьютерных) вычислительных систем семейства «СКИФ» (шифр «СКИФ-ГРИД»)
• Грант РФФИ № 06-01-00608-а (2006–2008) «Проблемы нестандартного анализа и теории множеств»
• Грант РФФИ № 06-04-48918-а (2006–2008) «Эволюция, система и филогения веслоногих ракообразных отряда Siphonostomatoida»
• Грант Международного Научно-технического Центра (МНТЦ) Проект 2766 (2004–2007) «Новые методы компьютерной аннотации бактериальных геномов: разработка и применение» (“New Methods of Computational Annotation of Bacterial Genomes: Development and Application”)
• Международный проект совместных работ Института проблем передачи информации РАН и Университета Бонна (Германия) «Теория множеств и ее применения к проблемам нестандартного анализа, теории моделей, информатики и биоинформатики» (2004–2007) (“Set theory and its applications to problems in nonstandard analysis, model theory, informatics, and bioinformatics”)

Гранты на участие в конференциях:

• Грант РФФИ № 11-04-09730-моб_з (2011) «Участие в международной конференции «Происхождение типов многоклеточных 2011 – новые данные, новые вызовы» (Deep Metazoan Phylogeny 2011 – new data, new challenges)»
• Грант РФФИ № 09-04-09230-моб_з (2009) «Участие в международной конференции "К юбилею Дарвина: от происхождения видов к происхождению типов многоклеточных" (“Celebrating Darwin: From The Origin of Species to Deep Metazoan Phylogeny”)»
• Грант РФФИ № 08-04-09233-моб_з (2008) «Участие в съезде общества молекулярной биологии и эволюции (Annual Meeting of the Society of Molecular Biology and Evolution, SMBE)»