Lab.6 IITP RAS logo
26/09/16
19:38:19

Лаборатория математических методов и моделей в биоинформатике
Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича
Российской академии наук

« back

Научная и педагогическая деятельность

Лаборатория № 6 образована решением Ученого совета Института в январе 2004 года на базе Сектора 1.1, созданного в 1998 году, в лаборатории продолжаются прежние темы: исследования в области алгоритмических моделей, методов эффективного описания объектов и процессов, которые ведутся в течение последних 20 лет, как и исследования в области математической биологии и биоинформатики, которые начались в этом коллективе в 1995 году.

За последние пять лет сотрудниками лаборатории опубликовано более 80 работ в ведущих отечественных и международных журналах и несколько монографий. Сотрудники лаборатории участвуют в международных конференциях по математике, математической биологии и биоинформатике, регулярно выезжают для совместной научной работы и чтения лекций в ведущие зарубежные университеты. За это время в лаборатории подготовлены и защищены 2 докторские и 4 кандидатские диссертации. За последние годы выполнены или выполняются работы по 32 зарубежным и отечественным грантам и проектам.

Деятельность лаборатории относится к двум основным направлениям:

  1. информационные процессы на молекулярном и клеточном уровнях;
  2. проблемы дискретной и многокритериальной оптимизаций, построение эффективных алгоритмов и моделей, проблемы разрешимости и выразимости в формализованных теориях, в том числе в самой широкой из них – теории множеств.

Главная цель лаборатории по направлению (I) состоит в разработке математических методов и моделей в математической биологии и биоинформатике и применении их к следующим проблемам:

  1. поиск регуляции экспрессии генов на уровнях транскрипции, трансляции и процессинга,
  2. выяснение механизмов регуляций и
  3. исследование эволюции регуляций – у бактерий, растений, водорослей, простейших и их органелл, включая пластиды и митохондрии;
  4. эволюция генов, эволюция видов и согласование этих эволюций;
  5. происхождение видов, роли горизонтальных переносов генов и других эволюционных событий в формировании геномов.

Средний возраст сотрудников лаборатории – 42 года. Основные публикации лаборатории приведены в разделе Публикации.

Сотрудники лаборатории регулярно читают курс лекций и ведут научный семинар в МГУ им. М.В. Ломоносова по понедельникам, начало в 16:45, в аудитории 14-08 главного здания МГУ. А также – читают лекции и ведут семинары в других московских вузах


Ранее в лаборатории выполнены гранты, среди которых отметим два более значимых:

  1. Грант Международного Научно-технического Центра (МНТЦ) Проект 2766 «Новые методы компьютерной аннотации бактериальных геномов: разработка и применение» (2004-2007 гг.). Англ. название: “New Methods of Computational Annotation of Bacterial Genomes: Development and Application”. Сумма гранта $255000.
  2. Грант Международного Научно-технического Центра (МНТЦ) Проект 3807 «Сравнительная геномика и метагеномика: модели, алгоритмы и массовый анализ; нанотехнологии для избирательного транспорта» (2008 г. – 2011 г.). Англ. название: “Comparative genomics and metagenomics: models, algorithms and large scale analysis; nanotechnologies for selective transport”. Сумма гранта $292968.

Текущие гранты лаборатории включают госконтракты Министерства образования и науки Российской Федерации:

  • контракт 14.740.11.0624 «Регуляция генов и эволюция регуляции у бактерий, пластид и паразитических простейших» (2010-2012);
  • контракт 14.740.11.1053 «Новые технологии реконструкции совместной эволюции регуляторных систем, пластид, генов и видов бактерий и простейших» (2011-2013);
  • контракт П1162 «Эволюция молекулярно-генетического аппарата клетки» (2010-2012);
  • соглашение 8091 «Массовый поиск и анализ процессов транскрипционной регуляции экспрессии генов в пластидах и митохондриях» (2012);
  • соглашение 8858 «Регуляция экспрессии генов у прокариот и простейших, включая возбудителей туберкулеза, токсоплазмоза и малярии» (2012);
  • соглашение 8481 «Регуляция экспрессии генов, ее механизмы и эволюция» (2012-2013).
  • грант РФФИ 13-04-40196-Н «Широкомасштабный биоинформатический поиск генов, играющих важную роль в развитии мозга и регенерации придатков тела» (2013-2015).
  • Весь список
« back