Lab.6 IITP RAS logo
20/09/17
22:15:32

Лаборатория математических методов и моделей в биоинформатике
Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича
Российской академии наук

« back

Научная и педагогическая деятельность

Лаборатория № 6 образована решением Ученого совета Института в январе 2004 года на базе Сектора 1.1, созданного в 1998 году. В лаборатории продолжаются прежние темы: исследования в области алгоритмических моделей, методов эффективного описания объектов и процессов, которые ведутся в течение последних 30 лет, как и исследования в области математической биологии и биоинформатики, которые начались в этом коллективе в 1995 году.

За последние пять лет сотрудниками лаборатории опубликовано более 100 работ в ведущих отечественных и международных журналах и несколько монографий. Сотрудники лаборатории участвуют в международных конференциях по математике, математической биологии и биоинформатике, регулярно выезжают для совместной научной работы и чтения лекций в ведущие зарубежные университеты. За это время в лаборатории подготовлены и защищены 2 докторские и 4 кандидатские диссертации. За последние годы выполнены или выполняются работы по 32 зарубежным и отечественным грантам и проектам.

Деятельность лаборатории относится к двум основным направлениям:

  1. информационные процессы на молекулярном и клеточном уровнях;
  2. проблемы дискретной и многокритериальной оптимизаций, построение эффективных алгоритмов и моделей, проблемы разрешимости и выразимости в формализованных теориях, в том числе в самой широкой из них – теории множеств.

Главная цель лаборатории по направлению (I) состоит в разработке математических методов и моделей в математической биологии и биоинформатике и применении их к следующим проблемам:

  1. поиск регуляции экспрессии генов на уровнях транскрипции, трансляции и процессинга,
  2. выяснение механизмов регуляций и
  3. исследование эволюции регуляций – у бактерий, растений, водорослей, простейших и их органелл, включая пластиды и митохондрии;
  4. эволюция генов, эволюция видов и согласование этих эволюций;
  5. происхождение видов, роли горизонтальных переносов генов и других эволюционных событий в формировании геномов.

Средний возраст сотрудников лаборатории – 40 лет. Основные публикации лаборатории приведены в разделе Публикации.

Среди сотрудников лаборатории – официальные эксперты РАН, РНФ, Сколково, Минобрнауки. Сотрудники ведут педагогическую работу (лекции, семинары, курсовые и дипломные работы, аспиранты) в Московском государственном университете им. М.В. Ломоносова (факультеты механико-математический и вычислительной математики и кибернетики), Московском государственном педагогическом университете и Московском государственном университете дизайна и технологии. А также – тесно сотрудничают с Научно-исследовательским центром электронной вычислительной техники. Сотрудники лаборатории являются членами двух докторских диссертационных советом по Информатики и Математической биологии, биоинформатики.

В лаборатории выполняются или выполнены гранты, среди которых отметим наиболее значимые:

  • Участие в Соглашении 14-50-00150 РНФ и ИППИ на 2014–2018 годы
  • Грант РФФИ № 13-04-40196-Н «Широкомасштабный биоинформатический поиск генов, играющих важную роль в развитии мозга и регенерации придатков тела» (2013–2015)
  • Грант МНТЦ № 2766 «Новые методы компьютерной аннотации бактериальных геномов: разработка и применение» (2004–2007)
  • Грант МНТЦ № 3807 «Сравнительная геномика и метагеномика: модели, алгоритмы и массовый анализ; нанотехнологии для избирательного транспорта» (2008–2011)
Более полный список приведён в разделе Гранты « back