Лаборатория математических методов и моделей в биоинформатике
Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича
Российской академии наук

• Научная деятельность
• Направления исследований
• Публикации
• Сотрудники
• Контакты

Научная и педагогическая деятельность

Лаборатория № 6 образована решением Ученого совета Института в январе 2004 года на базе Сектора 1.1, созданного в 1998 году, в лаборатории продолжаются прежние темы: исследования в области алгоритмических моделей, методов эффективного описания объектов и процессов, которые ведутся в течение последних 20 лет, как и исследования в области математической биологии и биоинформатики, которые начались в этом коллективе в 1995 году.

За последние пять лет сотрудниками лаборатории опубликовано более 80 работ в ведущих отечественных и международных журналах и несколько монографий. Сотрудники лаборатории участвуют в международных конференциях по математике, математической биологии и биоинформатике, регулярно выезжают для совместной научной работы и чтения лекций в ведущие зарубежные университеты. За это время в лаборатории подготовлены и защищены 2 докторские и 3 кандидатские диссертации. Подготовлены еще две кандидатские диссертации (О.Зверков, К.Лопатовская). За последние годы выполнены или выполняются работы по 32 зарубежным и отечественным грантам и проектам.

Деятельность лаборатории относится к направлениям: (I) информационные процессы на молекулярном и клеточном уровнях и (II) проблемы дискретной и многокритериальной оптимизаций, построение эффективных алгоритмов и моделей, проблемы разрешимости и выразимости в формализованных теориях, в том числе, в самой широкой из них – теории множеств.

Главная цель лаборатории по направлению (I) состоит в разработке математических методов и моделей в математической биологии и биоинформатике и применении их к следующим проблемам: (1) поиск регуляции экспрессии генов на уровнях транскрипции, трансляции и процессинга, (2) выяснение механизмов регуляций и (3) исследование эволюции регуляций – у бактерий, растений, водорослей, простейших и их органелл, включая любые пластиды и митохондрии; (4) эволюция генов, эволюция видов и согласование этих эволюций; (5) происхождение видов, роли горизонтальных переносов генов и других эволюционных событий в формировании геномов.

Средний возраст сотрудников лаборатории – 40 лет. Основные публикации лаборатории приведены в разделе Публикации.

Сотрудники лаборатории регулярно читают курс лекций и ведут научный семинар в МГУ им. М.В.Ломоносова по понедельникам, начало в 16:45, в аудитории 14-08 главного здания МГУ. А также – читают лекции и ведут семинары в других московских вузах

• Основные результаты лаборатории за 2011 год
• Основные результаты лаборатории за 2006-2010 годы по направлению (I)
• Презентация избранных работ лаборатории: часть 0, часть 1, часть 2
• Обзор научной деятельности лаборатории, конец 2008 г.
• Обзор научной деятельности лаборатории за период 2005-2007 гг.
• В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов «Эволюция РНК-полимераз и их промоторов в пластидах»
• В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов «Тканеспецифичная транскрипция в митохондриях хордовых в процессе онтогенеза»
• V.A. Lyubetsky, A.V. Seliverstov “Mathematical problems in biological evolution and molecular regulation”
• V.G.Kanovei, V.A.Lyubetsky “On the Hausdorff pantachy existence problem”

Текущие гранты лаборатории включают госконтракты Министерства образования и науки Российской Федерации:

• контракт 14.740.11.0624 «Регуляция генов и эволюция регуляции у бактерий, пластид и паразитических простейших»;
• контракт 14.740.11.1053 «Новые технологии реконструкции совместной эволюции регуляторных систем, пластид, генов и видов бактерий и простейших»;
• контракт НК-421П «Механизмы регуляции экспрессии генов бактерий, пластид растений и простейших»;
• контракт П1162 «Эволюция молекулярно-генетического аппарата клетки»;
• контракт 14.740.12.0830 «Процессы регуляции экспрессии генов в пластидах растений, водорослей, простейших и их эволюция».