Основные программные продукты, разработанные в лаборатории
Anneal
: Модель эволюции регуляторного сигнала со вторичной структурой- Госрегистрация № 2014615603 от 29.05.2014: Программа моделирования эволюции регуляторного сигнала с вторичной структурой – RSEVOL2STR.
ChromoGGL
: Построение кратчайшей последовательности хромосомных перестроек и восстановление хромосомных структурembed3GL
: Исследование совместной эволюции генов и видов- Госрегистрация № 2014615607 от 29.05.2014: Программа для филогенетического исследования совместной эволюции генов и видов – EMBED3GL.
iHCE
: Поиск высококонсервативных элементов в наборе геномов- Госрегистрация № 2020661965 от 05.10.2020: Программа PAIRHITS для нахождения пар приближенно совпадающих слов в двух последовательностях ДНК из разных геномов.
- Госрегистрация № 2020661964 от 05.10.2020: Программа BLDGRAPH для уплотнения исходного множества рёбер и построения начального многодольного графа.
- Госрегистрация № 2020662428 от 13.10.2020: Программа FINDENSE для построения финального графа и нахождения в нём m-плотных подграфов с наибольшим суммарным весом рёбер.
lossgainRSL
: Предсказание потерь и приобретений генов- Госрегистрация № 2019615070 от 18.04.2019: Программа LOSSGAINRSL для предсказания потерь и приобретений генов между несколькими наборами видов.
ProtFile
: Поиск белков по филогенетическому профилюProtClust
: База данных белков, кодируемых в пластидахRepIns
: Поиск вставок прямых повторов в некодирующих областяхRivals
/cpRivals
: Модель конкуренции РНК-полимераз- Госрегистрация № 2014615583 от 29.05.2014: Программа интерактивного моделирования взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз – RIVALS.
- Госрегистрация № 2014615585 от 29.05.2014: Программа параллельного моделирования взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз – CPRIVALS.
RNAmodel
: Модель РНК-овой регуляции у бактерий- Госрегистрация № 2014615584 от 29.05.2014: Программа моделирования классической аттенюаторной регуляции – RNAMODEL.
Super3GL
/Basis3GL
: Построение филогенетического супердерева- Госрегистрация № 2014615610 от 29.05.2014: Программа построения филогенетического супердерева – SUPER3GL.
- Госрегистрация № 2014662596 от 03.12.2014: Программа построения базисных деревьев для плохо обусловленного набора исходных деревьев генов – BASIS3GL.
TIQMax
: Анализ эволюции набора белковых семейств и построение дерева видовTwoBox
: Поиск мультибоксового регуляторного сигнала
См. также:
Свидетельства о государственной регистрации программ для ЭВМ
Полученные нами быстрые суперкомпьютерные программные разработки с оригинальными алгоритмами