Lab.6 IITP RAS logo
06/10/24
12:35:23

Laboratory of Mathematic methods and models in bioinformatics,
Institute for Information Transmission Problems,
Russian Academy of Sciences
« back

Основные программные продукты, разработанные в лаборатории

Быстрые суперкомпьютерные с оригинальными алгоритмами полученные нами программные разработки (12 штук)

См. также: Свидетельства о государственной регистрации программ для ЭВМ

  • Anneal: Модель эволюции регуляторного сигнала со вторичной структурой
    Программа моделирования эволюции регуляторного сигнала с вторичной структурой – RSEVOL2STR // гос. рег. № 2014615603 от 29.05.2014.
  • ChromoGGL: Построение кратчайшей последовательности хромосомных перестроек и восстановление хромосомных структур
  • embed3GL: Исследование совместной эволюции генов и видов
    Программа для филогенетического исследования совместной эволюции генов и видов – EMBED3GL // гос. рег. № 2014615607 от 29.05.2014.
  • iHCE: Поиск высококонсервативных элементов в наборе геномов
    Программа PAIRHITS для нахождения пар приближенно совпадающих слов в двух последовательностях ДНК из разных геномов // гос. рег. № 2020661965 от 05.10.2020.
    Программа BLDGRAPH для уплотнения исходного множества рёбер и построения начального многодольного графа // гос. рег. № 2020661964 от 05.10.2020.
    Программа FINDENSE для построения финального графа и нахождения в нём m-плотных подграфов с наибольшим суммарным весом рёбер // гос. рег. № 2020662428 от 13.10.2020.
  • lossgainRSL: Предсказание потерь и приобретений генов
    Программа LOSSGAINRSL для предсказания потерь и приобретений генов между несколькими наборами видов // гос. рег. № 2019615070 от 18.04.2019.
  • ProtFile: Поиск белков по филогенетическому профилю
  • ProtClust: База данных белков, кодируемых в пластидах
  • RepIns: Поиск вставок прямых повторов в некодирующих областях
  • Rivals / cpRivals: Модель конкуренции РНК-полимераз
    Программа интерактивного моделирования взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз – RIVALS // гос. рег. № 2014615583 от 29.05.2014.
    Программа параллельного моделирования взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз – CPRIVALS // гос. рег. № 2014615585 от 29.05.2014.
  • RNAmodel: Модель РНК-овой регуляции у бактерий
    Программа моделирования классической аттенюаторной регуляции – RNAMODEL // гос. рег. № 2014615584 от 29.05.2014.
  • Super3GL / Basis3GL: Построение филогенетического супердерева
    Программа построения филогенетического супердерева – SUPER3GL // гос. рег. № 2014615610 от 29.05.2014.
    Программа построения базисных деревьев для плохо обусловленного набора исходных деревьев генов – BASIS3GL // гос. рег. № 2014662596 от 03.12.2014.
  • TIQMax: Анализ эволюции набора белковых семейств и построение дерева видов
  • TwoBox: Поиск мультибоксового регуляторного сигнала
« back