Lab.6 IITP RAS logo
13/12/18
03:05:24

Лаборатория математических методов и моделей в биоинформатике
Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича
Российской академии наук

« back

Программы ChromoGGL

Программы Chromo и ChromoReconstruction предназначены для решения следующих трёх задач:

  1. Вычисление расстояния между двумя данными хромосомными структурами и построение кратчайшей последовательности операций, преобразующих одну структуру в другую.
  2. Вычисление матрицы попарных расстояний между хромосомными структурами из данного множества и построение дерева эволюции этих хромосомных структур, наилучшим образом согласованного с полученной матрицей.
  3. Реконструкция хромосомных структур, заданных в листьях дерева, обычно из пункта 2, возможно небинарного, на предковые вершины дерева; все структуры допускают паралоги.

Подробнее задачи и алгоритмы их решения описаны в Руководстве пользователя (ссылка ниже).

Файлы для загрузки:

« back