Пример 4 использования программы Super3GL

В Примере 4 используется набор исходных деревьев, состоящий из 1511 деревьев генов, взятых из 820 бактериальных видов (файл all_trees.tre). Метки листьев дерева содержат в качестве первого сегмента (до знака подчёркивания) сокращённые названия видов; далее идут номер генома и имя гена. Таблица расшифровки названий видов представлена файлом BacNames.csv. Из содержащихся в таблице 820 видов шесть вообще не встречаются в исходных деревьях генов; кроме того, в двух деревьях присутствует только один вид. Программа удаляет указанные данные как неинформативные, в результате остаётся 1509 деревьев с 814 видами.

Загрузить комплект файлов Примера 4: example814.zip.