Модель эволюции регуляторного сигнала со вторичной структурой
Содержательное описание модели детально изложено в публикации [1]
и коротко — в разделе 6 файла ReadMe.
Модель (версия 1.0.7) реализована в виде утилиты командной строки для 32-битной
среды Windows.
Детальные результаты для примеров из статьи [1]
Пример 1 (классическая аттенюаторная регуляция биосинтеза треонина в гамма-протеобактериях):
Пример 2 (классическая аттенюаторная регуляция биосинтеза лейцина в гамма-протеобактериях):
Пример 3 (подобен примеру 1, но содержит гены лидерного пептида):
[1] В.А. Любецкий, Е.А. Жижина, Л.И. Рубанов. Гиббсовский подход в задаче эволюции регуляторного сигнала экспрессии гена // Проблемы передачи информации, 2008, т. 43, № 4, с. 52-71. Перевод: V.A. Lyubetsky, E.A. Zhizhina, L.I. Rubanov. Gibbs field approach for evolutionary analysis of regulatory signal of gene expression // Problems of Information Transmission, 2008, Vol. 44, No. 4, P. 333–351. DOI: 10.1134/S0032946008040066