Исследования нарушения синтении
В рамках проекта «Поиск генов, играющих важную роль в развитии мозга и регенерации придатков тела» оригинальным алгоритмом было выполнено исследование синтении в геномах десями видов хордовых животных: Anolis carolinensis, Danio rerio, Gallus gallus, Homo sapiens, Monodelphis domestica, Mus musculus, Ornithorhynchus anatinus, Sarcophilus harrisii, Takifugu rubripes, Xenopus tropicalis.
Результаты приведены в следующих четырёх таблицах (документы Microsoft Excel в архиве, размер ~50 KB).
- слабая синтения, пары генов
- слабая синтения, тройки генов
- сильная синтения, пары генов
- сильная синтения, тройки генов
Независимо было проведено экспертное исследование синтении для отдельных генов с использованием общедоступных биоинформатических баз данных и баз знаний. Описание и результаты приведены в таблице.