10/04/25
06:16:36
Laboratory of Mathematic methods and models in bioinformatics,
Institute for Information Transmission Problems,
Russian Academy of Sciences

Исследования нарушения синтении

В рамках проекта «Поиск генов, играющих важную роль в развитии мозга и регенерации придатков тела» оригинальным алгоритмом было выполнено исследование синтении в геномах десями видов хордовых животных: Anolis carolinensis, Danio rerio, Gallus gallus, Homo sapiens, Monodelphis domestica, Mus musculus, Ornithorhynchus anatinus, Sarcophilus harrisii, Takifugu rubripes, Xenopus tropicalis.

... Результаты приведены в следующих четырёх таблицах (документы Microsoft Excel в архиве, размер ~50 KB).

  1. слабая синтения, пары генов
  2. слабая синтения, тройки генов
  3. сильная синтения, пары генов
  4. сильная синтения, тройки генов

Независимо было проведено экспертное исследование синтении для отдельных генов с использованием общедоступных биоинформатических баз данных и баз знаний. Описание и результаты приведены в таблице.