Пример 1 использования программы Super3GL

В Примере 1 используется набор исходных деревьев, состоящий из 1000 деревьев генов, взятых из 40 видов (файл input_trees.tre). Деревья не содержат имён самих генов, указано только сокращённое обозначение вида. Таблица видов не используется.

• Файл конфигурации программы для запуска в обычном режиме (фазы 1 и 2) — super3GL.ini.
• Командная строка запуска на 2 процессорах в среде MPICH2 v.1.3.2:

  mpiexec -np 2 super3GL

  Время исполнения на 2-ядерном процессоре Core2 Duo с тактовой частотой 2.53 ГГц — 11 мин.
• Файл базисных деревьев, полученный после выполнения фазы 1 — basis.tre.
• Файл супердерева, полученный после выполнения фазы 2 — super3.tre.
• Файл протокола работы — super3GL.log.

Загрузить комплект файлов Примера 1: example040.zip.