20/04/25
00:35:33
Laboratory of Mathematic methods and models in bioinformatics,
Institute for Information Transmission Problems,
Russian Academy of Sciences

Кластеризация белков

Разделение белков по семействам позволяет уточнять их аннотации и выполнять поиск белка по его филогенетическому профилю. Нами выполнено такое разделение (кластеризация) белков, кодируемых в пластомах некоторых таксономических групп. Использованный оригинальный алгоритм описан в статье [1]. Интерфейсы соответствующей базы данных доступны по ссылкам в разделе «Программы» (ниже на этой странице).

Статьи

  1. О.А. Зверков, А.В. Селиверстов, В.А. Любецкий «Белковые семейства, специфичные для пластомов небольших таксономических групп водорослей и простейших» Молекулярная биология, 2012, том 46, № 5, стр. 799–809.
    Текст статьи: PDF (draft), PDF (Eng).
    Дополнительные материалы: Список кластеров для пластид родофитной ветви.
  2. В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов, О.А. Зверков «Построение разделяющих паралоги семейств гомологичных белков, кодируемых в пластидах цветковых растений» Математическая биология и биоинформатика, 2013, том 8, № 1, стр. 225–233.
    Текст статьи: PDF,

Программы